Q1. Amplification 반응을 위해 정확도가 높은 PCR 효소 (High-fidelity PCR enzyme)의 사용이 필요한가요?
네, 다카라 DNA-Seq kit는 high-fidelity, high-processivity, low-bias DNA polymerase를 사용합니다.

Q2. DNA-Seq Kit에 사용 가능한 Thermal Cycler 장비는 어떤 것이 있나요?
다카라 DNA-Seq kit는 최종 반응 부피를 50 ㎕까지 수용할 수 있는 thermal cycler가 필요합니다.
사용하시는 PCR 기기의 설명서를 확인하세요.

Q3. DNA-Seq Kit 사용 시, 추가로 필요한 제품은 무엇인가요?
다카라 DNA-Seq kit를 사용하여 library를 제작 후, AMPure XP Beads (Beckman Coluter 사) 등으로 정제를 진행합니다. 각 제품 매뉴얼에서 ‘추가로 필요한 제품 (Additional Materials Required)’ 리스트를 확인해주세요.

Q4. DNA-Seq Kit 내에 포함된 모든 시약의 혼합 시, vortexing 해도 되나요?
아니오, Buffer와 nuclease-free water만 voltexing이 가능합니다.
Enzyme은 부드럽게 피펫팅하여 섞어주고 사용전에는 살짝 spin down 후 사용합니다. Index plate 또한 사용 전에 살짝 spin down하여 사용합니다.

Q5. DNA-Seq Kit을 methylation 연구에 적용할 수 있나요?
아니오, 다카라 DNA-Seq kit는 methylation 연구에 최적화되어 있지 않습니다. 이 경우, EpiXplore™ Meth-Seq DNA Enrichment Kit (Code 635023)를 권장합니다.

Q6. DNA-Seq Kit으로 제작한 library를 microarray나 PCR 분석용으로 사용할 수 있나요?
네, 다카라 DNA-Seq kit를 사용하여 제작한 library는 microarray나 PCR 분석에 사용할 수 있습니다.

Q7. PCR 증폭 (PCR amplification) 없이 library 제작이 가능한가요?
다카라 DNA-Seq kit를 사용하여 제작한 library는 PCR 증폭과정이 필요합니다. library 증폭 단계에 대한 자세한 설명은 사용자 매뉴얼에서 확인이 가능합니다.

Q8. Additional amplification 단계 전의 library 증폭 산물을 보관할 수 있나요?
최상의 성능을 유지하기 위해서는 DNA-Seq kit로 증폭 후 정제하지 않은 library는 -20 °C에서 최대 7일까지 보관할 수 있습니다 (추가 증폭 또는 정제하기 전 단계에서 보관).

Q9. NGS DNA-seq Kit은 single index를 사용하나요? Dual index를 사용하나요?
다카라 NA-Seq kit와 함께 사용할 수 있는 다양한 index가 있습니다. 대표적으로 single index kit와 dual index kit를 선택할 수 있습니다.

• DNA HT Dual Index kits
  DNA HT Dual Index kit는 ThruPLEX 및 PicoPLEX library prep kit와 함께 사용할 수 있으며, Illumina 장비에서 multiplexing을 위한 library를 제작하는데 사용합니다. kit는 Illumina Nextera® XT v2 index 서열을 갖는 PCR primer를 포함하고 있으며, 최대 384개 샘플의 multiplexing을 위한 총 384개의 dual index를 제공합니다. Indexing된 PCR primer는 각각 가능한 dual index 조합의 1/4에 해당하는 4개의 서로 다른 index plate에 미리 분주된 형태로 제공됩니다 (Code R400660, R400661, R400662, R400663). 각각 서로 다른 dual index 조합으로 구성된 24개의 개별 튜브 세트 (24N)를 함께 사용할 수 있습니다. 각 dual index tube (24N)는 튜브당 최대 2회 분량으로 제공되며, dual index plate (96N Set A-D)는 well당 1회 분량으로 제공됩니다.


• DNA Unique Dual Index kits
  DNA Unique Dual Index kit는 ThruPLEX 및 PicoPLEX library prep kit와 함께 사용할 수 있으며, Illumina 장비에서 multiplexing을 위한 library를 제작하는데 사용합니다. 이 kit는 IDT for Illumina UD index 서열을 갖는 PCR primer를 포함하고 있으며, 최대 96개 샘플의 multiplexing을 위한 총 96개의 dual index를 제공합니다. 각각 다른 index 시퀀스를 갖는 Index PCR primer는 24개의 개별 튜브로 구성된 4개의 서로 다른 세트에 미리 분주된 상태로 제공됩니다 (Code R400665 - R400668). 각각의 dual index tube (24U set A-D)는 튜브당 최대 2회 분량으로 제공됩니다.


• DNA Single Index kits
  DNA Single Index kit는 ThruPLEX 및 PicoPLEX library prep kit와 함께 사용할 수 있으며, Illumina 장비에서 multiplexing을 위한 library를 제작하는데 사용합니다. 이 kit는 TruSeq LT set A index 서열을 갖는 PCR primer를 포함하고 있으며, 최대 12개 샘플의 multiplexing을 위한 총 12개의 single index를 제공합니다. 각각 다른 index 서열을 갖는 index PCR primer는 12개의 개별 튜브로 구성된 2개의 서로 다른 세트에 미리 분주된 상태로 제공됩니다 (Code R400695, R400697). 각각의 single index tube (12S set A, B)는 튜브당 최대 8회 분량으로 제공됩니다.

Q10. NGS DNA-seq Kit의 보관 조건은 무엇인가요?
다카라의 DNA-Seq kit는 -20 °C에서 보관해야 합니다. 정확한 보관 방법은 각 제품의 Certificate of Analysis (CoA)를 참조하세요.

Q11. NGS DNA-seq Kit 보존 기간은 어떻게 되나요?
일반적으로 DNA-Seq kit의 유효기간은 권장 조건에서 보관한 경우 수령일로부터 1년입니다. 정확한 유효기간은 제품의 Certificate of Analysis (CoA)를 참조하세요.