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FFPE, cell-free DNA NGS library제작에 최적

ThruPLEX® DNA-Seq FLEX

제조사	제품코드	제품명	용량	가격 (부가세별도)
Clontech	R400737	ThruPLEX® DNA-Seq FLEX	24 회	997,000원
Clontech	R400736	ThruPLEX® DNA-Seq FLEX	96 회	2,950,000원
Clontech	635100	ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF	24 회 (Package)	1,122,000원
Clontech	635101	ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF	96 회 (Package)	3,464,000원

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간편한 single tube workflow로 샘플 loss 방지 및 시간 절약 가능
극소량 (pg수준) fragmented dsDNA만 있으면 Illumina 분석용 NGS library 제작 가능
- ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX : 250 pg - 200 ng
- ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX EF : 100 pg - 200 ng
Input양에 관계없이 재현성이 높고 균일한 커버리지 실현, GC 함량이 높은 영역도 균일한 커버리지 유지
분석이 어려운 FFPE 유래 DNA, cfDNA 등의 분석에 최적
Unique Dual Index kit (별도구매)와 같이 사용하면 384 샘플까지 multiplexing 가능
DNA 단편화 효소(enzymatic fragmentation)를 포함한 ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX EF 라인업

제품 설명

ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX chemistry는 최대 30 ㎕의 input volume을 적용할 수 있으며, single tube에서 약 2시간 만에 간편한 3-step workflow로 반응이 가능하다(그림 1). 중간 정제 단계가 없어 샘플 이동이 필요 없으므로 handling error나 샘플 loss를 방지할 수 있다. ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX와 Unique Dual Index kit (UDI, 별도구매)를 같이 사용하면, 최대 384개의 샘플을 multiplexing 할 수 있다. 본 시스템을 사용하면 novo sequencing, whole genome resequencing, whole exome sequencing과 다양한 enrichment techniques이 적용된 high-coverage deep sequencing에서 최고의 결과를 얻을 수 있다. Cell-free plasma DNA 혹은 formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) 조직에서 추출한 손상된 DNA 등 작은 fragment DNA 분석에 최적인 제품이다.
ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX EF는 ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX chemistry에 절편화 기능을 추가한 제품이다. 제품에 포함되어 있는 ThruPLEX^® FLEX Enzymatic Fragmentation Module은 ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX repair 과정에서, 효소를 이용하여 절편화 시키며, 절단되는 절편 크기도 조절할 수 있도록 설계되어 있다. 이를 통해 기계적인 절편화 (mechanical fragmentation) 혹은 별도의 효소를 이용한 절편화 과정을 생략할 수 있다.

그림 1. ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX를 이용한 single tube, 3-step workflow

그림 2. ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX 기술
Stem-loop adaptor를 repair 과정에서 blunt된 DNA의 5’ 말단에 ligation 시킨 후, high-fidelity polymerase로 barcode가 포함된 Illumina NGS library를 제작함.

[Input 샘플 정보]

	ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX	ThruPLEX^® DNA-Seq FLEX EF
Nucleic acid	Fragmented double-stranded DNA or cfDNA	Double-stranded DNA
Source	Cells, plasma, urine, other biofluids, FFPE, tissues, fresh tissues, frozen tissues	Cells, fresh tissues, frozen tissues, microbes
Type	Mechanically sheared; enzymatically fragmented; low-molecular-weight cell-free DNA	제품에 포함된 ThruPLEX^® FLEX Enzymatic Fragmentation Module 로 절편화하여 적용
Molecular size	<1,000 bp
Input 양	250 pg - 200 ng	100 pg - 200 ng
Input volume	30 ㎕
Input buffer	≤10 mM Tris, ≤0.1 mM EDTA

[참고]
ThruPLEX FLEX outperforms NEBNext Ultra II for DNA-seq of cell-free and FFPE DNA
(비교 데이터를 확인하려면, 클릭하세요)

자세한 구성은 CoA를 참고하세요.

Keyword :

High input DNA-seq

FFPE, cell-free DNA NGS library제작에 최적

ThruPLEX® DNA-Seq FLEX

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